董事會
	本會設置董事會，提供APIPA目標願景、長期策略規劃、政策方針及未來的營運方向的指導。並由捐款的機構(AT&T、工業技術研究院、資訊工業策進會等)、理律法律事務所以及國內關心智慧財產權之企業推派代表擔任董事，共同組成，選舉董事長，對外代表本會。 現任董事長為柯志昇先生(資訊工業策進會資深專家、資鼎中小企業開發（股）公司董事長)，董事成員如下 ： 史欽泰－資訊工業策進會董事長 王本耀－工業技術研究院技術移轉中心主任 杜東佑－台灣積體電路製造（股）公司副總經理暨法務長 徐小波－宇智顧問(股)公司董事長暨執行長 梁啟銘－中央研究院公共事務組主任 陳文義－台灣區電機電子工業同業工會秘書長 蔣大中－理律法律事務所合夥律師 蔡坤財－中華民國專利師公會理事長                                                                    羅方禎－友達光電（股）公司副總經理 吳欽智－華碩電腦（股）公司技術長 許維夫－聯發科技（股）公司法務長 梁榮昌－台達電工業（股）公司技術長 蔡練生－中華民國全國工業總會秘書長 卓永財－上銀科技（股）公司董事長
	諮詢委員會
	敦聘政府官員、學者專家以及相關企業界人士為委員，提供本會智權相關政策 諮詢意見。
	執行長
	稟承董事會決議方針，綜理本會之一切業務，現任執行長為賴士煥。
	核心小組
	協助執行長規劃本會推動智權相關業務之策略、智權資訊諮詢、服務內容及智權人才培育方向，成員名單如下－ 樊治齊－工業技術研究院技術移轉中心智權法務組組長 戴豪君－資訊工業策進會科技法律研究所所長 王惠玲－惇安智慧財產管理股份有限公司董事長 羅麗珠－醫藥工業技術發展中心總經理 方環玉－理律法律事務所顧問
	執行處
	綜理人事、總務、文書等行政業務，並辦理董事會、諮詢委員會、核心小組、智權論文獎學金及專業人員出國考察與進修獎助金之相關業務。
	財務處
	綜理財務、會計及出納業務。
	數據資料營運處
	策劃、設計、建置、發展以及維謢智慧財產權資料庫系統
	企劃推廣處
	規劃及推動智慧財產權之相關活動，包括研討會、推廣活動、專利分析人才培訓、與大陸互訪合作以及協助學校培育智權人才等。並設置智權情報網提供智權活動訊息、專家論壇及詢答服務(Q&A)。此外，更致力於智權相關政策之研究。